Comme la plupart des musées, le Musée de Bretagne suit une politique d'acquisition définie par son équipe scientifique. A l'heure actuelle, elle vise d'une part à combler des lacunes dans des domaines jusqu'alors assez pauvres comme la pêche, l'ostréiculture, la construction navale, le costume traditionnel ancien ou l'industrie de la chaussure attachée à la ville de Fougères (Ille-et-Vilaine).

Elle a également pour but de compléter des ensembles déjà bien constitués qui font la réputation du Musée comme le fonds lié à l'Affaire Dreyfus. Pour cela, divers moyens d'enrichissement des collections existent  : le don, le legs, l'achat ou le dépôt par un autre musée par exemple.